海鲜所含的重金属主要来自受污染的海水，其中最常见且毒性最强的主要有水银及镉。

水银：许多食物皆含水银，但毒性远不及海产，因后者是经过细菌转化而成的有机水银，人体吸收后极难排解，长期可损害神经系统，令人容易疲乏、烦躁、失眠、情绪低落，高水银的孕妇甚至可影响到胎儿智力发展。九七年香港稀有金属医学研究基金更发现，两百名长期患有神经痛患者，血液水银含量平均较正常高出两成，有的更高出八倍。

镉：主要是来自受工业电镀原料污染的海水，长期进食含有过量镉的食物，镉会积累肝肾组织，抑制免疫力，损害微细血管。瑞士学者进行老鼠实验发现，吸收过量镉可增加高血压、心脏病、肾衰竭、肺癌及前列腺癌的风险。